PCR實驗也叫基因擴增實驗，PCR實驗室就是專門進行基因擴增實驗的地方。PCR是分子生物學研究技術，用來研究放大特定的DNA片段：比如PCR核酸監測、DNA指紋等，通過DNA基因追蹤系統確定病人體內的病毒含量的多少，從而給臨床治療提供可靠的檢驗依據。
PCR實驗室分4個單獨的工作區域：試劑準備區、樣品制備區、擴增區、擴增產物分析區，每個分區進行不同的實驗操作。
一、試劑準備區：
用于配制、分裝和保存擴增試劑。試劑以及用于制作標本的材料要直接運送到該區域，不能經過其他區域。
二、樣品制備區：
實驗室樣品的混樣以及測試樣品的制備：如臨床標本的保存、核酸的提取和貯存及其加入到擴增反應管和測定RNA時cDNA的合成。在使用前要對所用的器具進行徹底清洗并消毒，防止交叉污染。在進行加樣操作時也有發生氣溶膠污染的風險，所以應盡量避免在本區內進行不必要的走動。
三、擴增區：
PCR擴增反應體系的配制和模板的加入（該區域主要進行的操作為DNA或cDNA擴增）。為避免氣溶膠從本區漏出，該工作區域為負壓，可安裝排風系統。加樣要在超凈工作臺內進行，超凈工作臺的氣流方向以選擇垂流式為宜。
四、擴增產物分析區：
該區域主要進行擴增產物的測定，為避免擴增產物從本區擴散到其它區域，該工作區為負壓，應安裝排風系統。如果使用全自動封閉分析儀器檢測，也可以不設置該區域。
